قسم التجليد هو الجزء المكمل لعملية المحافظة على المخطوطات والكتب النادرة فبعد الانتهاء من عمليتي المعالجة والترميم يتولى قسم التجليد عملية إعادة تجليدها من جديد بالجلد الطبيعي أو الصناعيه وزخرفتها بالنقوش المذهبة، وكذلك عمل صناديق وعلب ذات مواصفات لحفظ الوثائق والمقتنيات التاريخية المهمة. ويقوم القسم بعمل أنواع من التجليد منها على سبيل المثال، الفني الفاخر والملكي أراقي والرماني، إَضافة إلى عدد من الأعمال اليدوية الدقيقة التي تحافظ على البصمة التاريخية سواء كانت مخطوطاً أم كتاباً أم وثيقة. وقد تم تجهيز قسم التجليد بما يحتاج إليه من الأدوات والتجهيزات الحديثة وما يتطلبه من مكابس يدوية وماكينات آلية لقص الورق والكارتون. وقد تم تزويد القسم بما يحتاجه العمل: آلة تذهيب وآلة بصم وكتابة العناوين، ومن النقوش والزخارف الإسلامية لعمل زخارف المخطوطات بالشكل القديم وكل ذلك كان له انعكاساً إيجابياً على الأسلوب المتطور والمتميز لإنتاجية قسم التجليد والمستوى الراقي الذي وصل إليه